1、营利目标不同：会员制交易所通常不以营利为目标；公司制交易所通常以营利为目标，追求交易所利润最大化；2、适用法律不同：会员制交易所一般适用民法的有关规定；公司制交易所首先适用公司法的规定，只有在公司法未作规定的情况下，才适用民法的一般规定；3、决策机构不同：会员制交易所的权力机构是会员大会，公司制交易所的权力机构是股东大会；会员制交易所权力机构的常设机构是理事会，公司制交易所权力机构的常设机构是董事会；4、组织架构不同。
会员制交易所由全体会员共同出资组建，缴纳一定会员资格费，作为注册资本，交纳会员费是取得会员资格的基本条件之一，不是投资行为，不存在回报。
公司制交易所由若干股东共同出资组建，以营利为目的，中国金融期货交易由上海期货交易所、大连商品交易所、郑州商品交易所、上海证券交易所、深圳证券交易所5家股东各出资1亿元组成。
公司制和会员制期货交易所有以下几点区别：
1、营利目标不同
会员制期货交易所通常不以营利为目标；公司制期货交易所通常以营利为目标，追求交易所利润最大化。
2、适用法律不同
会员制期货交易所一般适用民法的有关规定；公司制期货交易所首先适用公司法的规定，只有在公司法未作规定的情况下，才适用民法的一般规定。
3、决策机构不同
会员制期货交易所的权力机构是会员大会，公司制期货交易所的权力机构是股东大会；会员制期货交易所权力机构的常设机构是理事会，公司制期货交易所权力机构的常设机构是董事会。
4、组织架构不同
会员制期货交易所由交易所全体会员出资组成，其常设机构为会员大会、理事会、专门委员会、经营管理层和业务管理部门；公司制期货交易所有多个股东出资组成，其常设机构为股东大会、董事会、监事会及高级管理人员。
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